Conforme CGU, prejuízo causado pelo Ministério dos Transportes foi de 

R$ 682 milhões.

A Controladoria-Geral da União (CGU) analisou 17 processos no Ministério dos Transportes e encontrou 66 irregularidades. A auditoria foi realizada depois das denúncias contra o Ministério, em julho deste ano. A CGU calculou um prejuízo de R$ 682 milhões, em uma quantia de R$ 5,1 bilhões que foram fiscalizados. Segundo o órgão, já havia sete Processos Administrativos Disciplinares, uma Sindicância Patrimonial e uma Sindicância Investigativa, contra 30 servidores e ex-dirigentes do Departamento Nacional de Infraestrutura de Transportes (Dnit), da estatal de ferrovias (Valec) e do Ministério dos Transportes.